休士頓火箭隊時期

2013年2月6日，主場對戰金州勇士隊，火箭隊全場飆進23記三分球，命中率高達57.5%，不僅刷新隊史紀錄，更追平奧蘭多魔術隊23顆三分球紀錄，其中林書豪投8進5，是投進最多的球員，而上半場火箭隊3分球18投14中，也追平密爾瓦基公鹿隊的半場最多3分球紀錄；這場比賽火箭最終以140比109大勝勇士隊。^[68]

2月17日，參加NBA全明星週的技術挑戰賽，以35.8秒完成賽事，排名第4。^[69]

4月18日，例行賽最後一場對戰湖人隊，雖最終在延長賽以95:99落敗，但仍以西區第八的成績進入季後賽；這是林書豪生涯首次完成整個賽季，且全勤打滿82場球賽，每場皆擔任先發。^[70]

4月21日，生涯首度體驗季後賽，上場約32分鐘，2罰2中，繳出4分、4助攻、3籃板、2抄截，另有4失誤、5犯規，全隊最後以91:120敗給奧克拉荷馬雷霆。^[71]而之後因在對戰雷霆的第二場比賽中右胸挫傷，受到傷勢影響，在季後賽林書豪一共出戰的四場比賽中，僅留下平均4分、2助攻、2籃板的成績。[72]